江阴华东水处理有限公司表示，反渗透系统运行一段时间后，反渗透膜元件可能会受到给水中存在的悬浮物或难溶盐的污染，这些污染中常见的是碳酸钙、硫酸钙、金属(铁、锰、铜、镍、铝等)氧化物、硅沉积物、无机或有机混合物、天然有机物质、合成有机物、微生物(藻类、霉菌、真菌)等污染。

污染性质和污染速度取决于各种因素：如给水水质和系统回收率。通常污染是渐进发展的，如不尽早控制，污染将会在相对较短的时间内损坏膜元件。当膜元件确认已被污染，或在长期停机之前，或是作为定期日常维护，都需对膜元件进行清洗。